医院始建于1888年，前身为“中华基督教礼贤会东莞普济医院”，是我国最早建立的西医院之一，也是我国第一家德国教会医院。经过130多年的积淀，现已发展成为集医疗、教学、科研及预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院。2020年12月，东莞市人民政府与南方医科大学签订合作共建协议，医院成为南方医科大学附属东莞医院。2021年3月，医院入选广东省高水平医院重点建设医院。2022年1月，BNCT治疗中心项目、科教综合楼和急救中心工程TOD项目正式启动。

医院总占地面积35.73万平方米，建筑面积32.57万平方米，下辖红楼院区、普济院区2个院区，中心门诊部、第一门诊部、第二门诊部3个门诊部，定编床位3100张，实际开放床位3020张，并先后与谢岗医院、石碣医院、市康复医院、黄江医院、望牛墩医院等建立医疗联合体。年门、急诊量近360万人次，出院人次12.6万，手术（含操作）9.6万台次。在岗员工4619人，其中，正高职称218人、副高职称558人，博士72人（其中博士后12人）、硕士535人，享受“国务院政府特殊津贴”专家2名，广东省名中医3名、广东省杰出青年医学人才3名，东莞市特色人才5名、市名医58名、市医学领军人才8名、市医学学科带头人35名、市杰出青年医学人才18名、市医学学科骨干213名。

医院专业分工细，覆盖病种齐全，设有43个临床学科，8个医技科室，拥有呼吸内科、神经内科、内分泌科、肾内科、神经外科、胸外科、眼科、烧伤整形科、肿瘤科、病理科、临床护理等11个广东省临床重点专科，1个省“十一五”医学特色专科（肿瘤科），中西医结合肿瘤科、中医护理、中医临床药学等3个省“十三五”中医药重点专科建设项目，消化内科、心血管内科、普外科、乳腺科、麻醉科、泌尿外科、骨外科、口腔科、耳鼻喉科、心脏大血管外科、产科、妇科、新生儿科、重症医学科、超声医学科、医学影像科、检验科、核医学科、介入科、老年护理、手术室护理、重症护理等36个市临床重点专科和助产护理1个市临床特色专科。拥有1个国家级青年文明号，3个省级青年文明号，8个市级青年文明号。国家胸痛中心、国家房颤中心、国家房颤中心示范基地、国家心衰中心、国家高级卒中中心、国家二级癫痫中心、国家药物临床试验机构、Ⅰ期临床试验中心、国家标准化代谢性疾病管理中心、广东省肿瘤诊疗建设示范单位、广东省胸痛中心示范基地，广东省第一批市级心血管病防治中心，以及多个国家级、省级、市级培训基地和东莞市限制临床应用医疗技术质量控制中心先后落户我院。

医院技术力量雄厚，注重发展高新技术，先后开展了造血干细胞移植技术、同种异体皮肤移植技术、放射性粒子植入技术、肿瘤消融治疗技术、肿瘤深部热疗和全身热疗技术等多项国家级限制类技术，心血管病介入治疗技术、神经血管介入诊疗技术及髋、膝关节置换术等多项广东省限制类技术。在微创、介入等多个医疗技术领域居省内先进水平，腔镜技术已向减孔、单孔、自然腔道等方向发展。开展房颤冷冻消融术、房颤Marshall韧带消融术、各类快速型心律失常的射频消融，无导线起搏器植入术，三腔起搏器植入术、希氏束起搏技术，左束支区域起搏技术、B超引导下起搏器植入，经皮主动脉瓣置换术（TAVR）、左心耳封堵术、各类先天性心脏病微创封堵术，血管荧光辅助下颅内动脉瘤夹闭及脑血管搭桥、肝复发癌再切除或微创消融并分子靶向免疫综合治疗、CT引导下经皮经肝穿刺第9段肝脏肿瘤微创消融、经皮经肝穿刺胆道取石术等多项高新技术。

医院拥有一大批先进的医疗设备，总价值约13.58亿元。包括PET/CT、SPECT/CT、3.0T磁共振、256层CT、双源CT、全数字化血管减影（DSA）系统、实时四维图像引导直线加速器系统、多层螺旋CT模拟定位机、高剂量率后装机、经颅多普勒及无创血压监测系统、超高清神经内镜系统、眼科准分子激光手术系统及配套设备、体外生命支持系统（ECMO）、外科手术导航系统等，显著提升了医院整体医疗技术水平和急危重症处置能力，保障了临床诊断及治疗工作顺利开展。

医院坚持走科教兴院、医教相长之路，是广东省博士工作站、广东省博士后创新实践基地，拥有东莞市重点实验室4个。是南方医科大学、暨南大学、广东医科大学、遵义医科大学医学研究生培养点，南方医科大学附属东莞医院、广东医科大学东莞临床医学院、国家首批住院医师规范化培训基地。承担着中山大学、南方医科大学、广东医科大学等全国10余所高等医学院校的临床教学和实习任务。现有博士生导师6人，硕士生导师40人，兼职教授、副教授及讲师48人。重视科研人才培养、引进和科研投入，已接收进站博士后21人。是东莞市肿瘤临床医学研究所、东莞市呼吸和重症医学研究所、东莞市公立医院中心实验室的依托单位。近5年承担国家、省、市等各级科研课题320项，其中国家自然科学基金9项，广东省基础与应用基础研究省市联合基金重点项目7项；获市级以上科技进步奖13项，发表医学论文约1850篇，其中SCI论文163篇。医院于2012年获得国家药物临床试验机构资格认定，至今已备案药物临床试验专业14个、医疗器械临床试验专业24个，并于2018年建成Ⅰ期临床试验中心。主持和参与Ⅰ类创新药物、国际多中心新药、仿制药生物等效性、新医疗器械、新体外诊断试剂等注册类临床试验项目超过100项。

医院坚持“医护同心，关爱社群”的服务宗旨，致力于打造有“温度”的医院，不断优化就医流程，提高工作效率，提升服务品质。1994年获国家“爱婴医院”，1995年被国家卫生部评为“三级甲等”医院，1998年被授予“广东省高等医学院校教学医院”。近年来，先后获得全国百姓放心示范医院、全国百佳优质示范品牌医院、全国综合医院中医药工作示范单位，广东省文明单位、文明医院、百家文明医院、卫生系统行业作风建设先进集体，东莞市文明示范单位、固本强基工程市级示范点、卫生工作先进单位、文化建设标兵医院、市园林单位等荣誉。医院党委荣获“广东省先进基层党组织”和全省公立医院党建“四有工程”示范点称号。医院稳居全国地级市医院竞争力榜单前列，连续8年保持全省地级市医院竞争力前三位，获“粤港澳大湾区最佳医院”称号。2018年3月，医院高分通过“三甲”复审，标志着医院在新医改形势下的医疗服务能力和整体水平迈上了一个新台阶。在国家三级公立医院绩效考核中取得A等级。

在新的征程上，医院将秉承“自强不息，仁爱博精”的院训，以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面贯彻落实党的十九大精神，牢固树立以人民为中心的发展思想，以人民群众的满意度为标准，继承和发扬百年红楼精神，充分发挥在全市医疗行业的龙头作用，以建设广东省高水平医院和粤港澳大湾区区域医疗中心为目标，力争在提高医疗品质、提升科教水平、优化服务体系、建设“智慧医院”、开展社会服务和改善医院环境等方面取得新突破，为东莞在“双万”新起点上加快高质量发展提供坚实医疗保障。